Con un coste de 1,6 millones y 28 meses de duración, la madera del retablo mayor también será sometida a un tratamiento con la restauración de sus sistemas constructivos y estructurales, para después concluir con el tratamiento de dorados y policromías. Para la realización de la restauración, en la que van a participar 50 especialistas, los operarios han montado un andamio de 12 pisos, de los cuales los dos primeros podrán ser visitados a partir de 2013, cuando los trabajos estén más avanzados.
El canónigo Francisco Navarro explicó que el coste de las obras se sufragará con los recursos propios de la Catedral, que tiene un presupuesto anual de 10 millones de euros, el 95 % de ellos procedentes de los turistas, que el año pasado aumentaron un 11 % respecto al anterior y que este año se espera que desciendan un 6 %. Navarro añadió que aprovechando el montaje de los andamios también van a restaurar dos cristaleras y una bóveda, y avanzó que tras la Semana Santa se empezará la limpieza de la fachada del Patio de los Naranjos, actuación que costará 1,5 millones de euros.